연말정산 의료비 공제 조회 바로가기, 공제되는 병원비 확인
연말정산 의료비 공제 내역은 국세청 홈택스 연말정산 간소화 서비스에서 병원·약국별로 조회할 수 있습니다. 2026년 귀속 의료비는 2027년 1월 중순 간소화 서비스 개통 후 확인할 수 있으며, 그전에는 건강보험심사평가원의 내 진료정보 열람 서비스에서 건강보험 진료내역을 미리 확인할 수 있습니다. 간소화 자료에 빠진 의료비는 신고센터를 이용하거나 병원에서 영수증을 발급받아 추가 제출하면 공제받을 수 있습니다.
연말정산에서 의료비 세액공제를 받으려면 병원과 약국에서 실제로 얼마를 지출했는지부터 확인해야 합니다.
대부분의 병원비는 국세청 홈택스 연말정산 간소화 서비스에서 자동으로 조회되지만, 일부 의료비는 자료가 빠지거나 늦게 반영될 수 있습니다.
특히 치과 치료비, 안경 구입비, 보청기, 산후조리원 비용처럼 별도 증빙이 필요한 항목을 놓치면 공제받을 수 있는 금액이 줄어들 수 있습니다.
연말정산 의료비 공제 조회방법, 올해 병원비를 미리 확인하는 방법, 공제되는 병원비와 제외 항목, 누락된 의료비 추가방법까지 알아보겠습니다.
연말정산 의료비 공제 조회, 어디서 하나요?
의료비 지출내역을 확인하는 방법은 크게 두 가지입니다.
연말정산에 실제로 제출할 의료비 자료는 국세청 홈택스에서 확인하고, 연말정산 간소화 서비스가 열리기 전에는 건강보험심사평가원에서 일부 진료내역을 미리 살펴볼 수 있습니다.
다만 두 서비스는 제공하는 정보와 사용 목적이 다릅니다.
| 구분 | 홈택스 연말정산 간소화 | 심평원 내 진료정보 열람 |
|---|---|---|
| 주요 목적 | 연말정산 공제자료 조회 | 건강보험 진료내역 확인 |
| 조회 시기 | 매년 1월 중순 개통 | 연중 이용 가능 |
| 조회 내용 | 의료비 지출액, 실손보험금 등 | 진료일, 의료기관, 급여 진료비 등 |
| 비급여 의료비 | 제출된 자료 조회 가능 | 원칙적으로 조회 불가 |
| 조회 대상 기간 | 선택한 귀속연도 | 최근 5년 이내 |
| 연말정산 제출 | 공제자료로 활용 가능 | 참고용, 공제 증빙 대체 불가 |
2026년 10월 현재 2026년 귀속 연말정산 간소화 자료는 아직 제공되지 않습니다.
따라서 올해 방문한 병원이나 진료내역을 미리 확인하려면 심평원을 이용하고, 2027년 1월에 홈택스에서 최종 의료비 지출액을 확인하는 것이 좋습니다.
주의할 점은 심평원 자료가 실제 결제한 전체 병원비를 보여주는 서비스는 아니라는 것입니다.
건강보험 급여 청구자료를 기준으로 제공되기 때문에 비급여 진료비나 아직 청구·심사가 완료되지 않은 내역은 확인되지 않을 수 있습니다.
홈택스에서 의료비 공제 내역 조회하는 방법
국세청은 매년 1월 중순 연말정산 간소화 서비스를 개통합니다.
2025년 귀속 연말정산의 경우 2026년 1월 15일 서비스를 개통했고, 의료기관 등이 추가 제출하거나 수정한 자료는 1월 20일부터 최종 확정자료로 제공했습니다.
2026년 귀속 연말정산 역시 2027년 1월 중순에 개통될 예정이지만 정확한 일정은 국세청 공지를 확인해야 합니다.
홈택스 PC 조회 순서
- 국세청 홈택스에 접속합니다.
- 공동인증서 또는 간편인증으로 로그인합니다.
- ‘장려금·연말정산·기부금’ 메뉴를 선택합니다.
- ‘연말정산 간소화’에서 소득·세액공제 자료 조회로 이동합니다.
- 조회할 귀속연도와 해당 월을 선택합니다.
- 의료비 항목의 조회 버튼을 누릅니다.
- 병원·약국별 의료비 지출내역을 확인합니다.
- 필요한 자료를 PDF로 내려받거나 회사에 제출합니다.
홈택스 메뉴 명칭이나 위치는 서비스 개편에 따라 달라질 수 있습니다.
연말정산 간소화 화면에서 의료비 항목을 선택하면 국세청에 제출된 병원비와 약제비 자료를 확인할 수 있습니다.
다만 간소화에 표시된 금액은 의료기관 등이 제출한 자료이므로 실제 세액공제 가능 여부를 별도로 확인해야 합니다.
모바일 손택스에서도 조회할 수 있을까?
국세청 손택스 앱에서도 연말정산 간소화 자료 조회가 가능합니다.
앱에 로그인한 뒤 연말정산 간소화 메뉴에서 의료비 항목을 선택하면 됩니다.
자료 제출 방식은 회사에서 사용하는 연말정산 시스템에 따라 다르므로 PDF 제출이 필요한지, 간소화 자료 일괄제공 서비스를 사용하는지 확인하는 것이 좋습니다.
2026년 병원비, 지금 미리 조회하는 방법
2027년 연말정산까지 기다리지 않고 올해 병원에 다녀온 내역을 확인하고 싶다면 건강보험심사평가원의 ‘내 진료정보 열람’ 서비스를 이용할 수 있습니다.
이 서비스는 최근 5년간의 건강보험 진료정보를 본인이 직접 조회하는 기능입니다.
심평원 진료정보 조회 순서
- 건강보험심사평가원 홈페이지에 접속합니다.
- ‘조회·신청’ 메뉴를 선택합니다.
- ‘내 진료정보 열람’으로 이동합니다.
- 본인인증을 진행합니다.
- 조회할 기간을 설정합니다.
- 병원별 진료내역과 본인부담금 등을 확인합니다.
심평원에서는 진료를 받은 날짜와 의료기관명, 건강보험 청구 진료비 등을 확인할 수 있습니다.
다만 모든 진료정보가 실시간으로 표시되는 것은 아닙니다.
의료기관의 청구와 심사 과정에 따라 진료일 기준 최대 3개월의 시차가 발생할 수 있으며, 비급여 진료정보는 조회 대상에서 제외될 수 있습니다.
따라서 심평원 자료를 실제 연간 병원비 총액으로 생각하면 안 됩니다.
특히 MRI 비급여 검사비, 도수치료비 등은 자료에 나타나지 않을 수 있으므로 해당 의료기관의 영수증을 별도로 보관해야 합니다.
심평원 조회 결과는 병원 방문내역을 확인하는 참고자료이며, 회사에 제출하는 연말정산 의료비 공제 증빙을 대신하지 않습니다.
연말정산 의료비 공제되는 병원비는?
의료비 세액공제는 질병의 진찰·치료 등을 위해 의료기관에 지출한 비용과 세법에서 별도로 인정하는 의료비를 대상으로 합니다.
건강보험이 적용되는 급여 진료비뿐 아니라 일부 비급여 진료비도 공제받을 수 있습니다.
중요한 것은 건강보험 적용 여부가 아니라 세법상 의료비 공제 대상에 해당하는지입니다.
| 의료비 항목 | 공제 가능 여부 |
|---|---|
| 병원·의원 진찰료 | 가능 |
| 입원비·수술비 | 가능 |
| 치과 충치치료·임플란트 | 가능 |
| 건강검진 비용 | 가능 |
| 한의원 치료비 | 가능 |
| 처방약·치료 목적 의약품 | 가능 |
| MRI·CT 검사비 | 치료·진단 목적이면 가능 |
| 도수치료 등 비급여 치료 | 요건 충족 시 가능 |
| 시력교정용 안경·콘택트렌즈 | 1인당 연 50만 원 한도 |
| 보청기·장애인 보장구 | 요건 충족 시 가능 |
| 산후조리원 비용 | 출산 1회당 200만 원 한도 |
| 노인장기요양급여 본인부담금 | 법정 요건 충족 시 가능 |
같은 의료기관에서 지출했더라도 진료 목적에 따라 공제 가능 여부는 달라질 수 있습니다.
예를 들어 피부과에서 습진이나 아토피 치료를 받았다면 공제 대상이 될 수 있지만, 단순한 피부 미용 목적의 시술은 공제 대상이 아닙니다.
치과 임플란트와 스케일링도 공제될까?
치과에서 지출한 의료비는 치료 목적이라면 대부분 의료비 세액공제 대상에 해당합니다.
충치치료, 신경치료, 발치, 잇몸치료, 스케일링, 임플란트, 틀니 등이 대표적입니다.
특히 임플란트는 비급여로 시술받았더라도 질병 치료 목적의 의료비라면 세액공제 대상에 포함될 수 있습니다.
반면 단순 미용 목적의 치아미백이나 치아교정은 공제 대상에서 제외됩니다.
다만 치아교정이 저작기능장애 등 의료적 필요에 따라 이루어진 경우에는 예외적으로 공제가 가능할 수 있습니다.
이 경우 의료기관에서 발급한 진단서 등 관련 증빙이 필요할 수 있으므로 치과에 확인해야 합니다.
안경·보청기·산후조리원 비용도 확인하세요
일반적인 병원 진료비 외에도 연말정산에서 놓치기 쉬운 의료비 항목이 있습니다.
시력교정용 안경과 콘택트렌즈
시력교정용 안경과 콘택트렌즈 구입비는 1명당 연간 50만 원 한도에서 의료비 세액공제 대상이 됩니다.
본인이 40만 원, 배우자가 30만 원을 지출했다면 각각 공제 요건을 충족하는 경우 총 70만 원을 공제 대상 의료비에 포함할 수 있습니다.
반면 한 사람이 70만 원을 지출했다면 최대 50만 원까지만 인정됩니다.
패션용 선글라스나 미용 목적의 콘택트렌즈는 공제 대상이 아닙니다.
안경 구입내역이 홈택스에서 조회되지 않으면 구입한 안경점에서 시력교정용 안경 구입확인서를 발급받아야 합니다.
보청기 구입비
보청기 구입비도 의료비 세액공제 대상에 포함될 수 있습니다.
연말정산 간소화 자료에서 확인되지 않는다면 판매처에서 사용자와 구입금액이 확인되는 증빙서류를 발급받아 제출할 수 있습니다.
산후조리원 비용
산후조리원 비용은 출산 1회당 200만 원 한도에서 의료비 세액공제 대상이 됩니다.
2024년 지출분부터는 기존 총급여 7,000만 원 이하 요건이 폐지되어 총급여와 관계없이 다른 요건을 충족하면 공제받을 수 있습니다.
간소화 자료에서 조회되지 않는다면 산후조리원에서 이용료 영수증을 발급받아야 합니다.
연말정산 의료비 공제 안 되는 항목은?
의료기관에서 결제했더라도 미용·성형 목적의 지출은 원칙적으로 의료비 세액공제 대상이 아닙니다.
또한 건강보험과 관련된 모든 지출이 공제되는 것도 아닙니다.
| 지출 항목 | 공제 제외 이유 |
|---|---|
| 미용 목적 성형수술 | 치료 목적이 아님 |
| 미용 목적 피부시술 | 외모 개선 목적 |
| 건강기능식품 구입비 | 세법상 의료비 대상 아님 |
| 건강증진 목적 의약품 | 치료·요양 목적이 아님 |
| 간병인에게 지급한 비용 | 법정 의료비 대상 아님 |
| 해외 의료기관 진료비 | 국내 의료기관 요건 미충족 |
| 패션용 안경·선글라스 | 시력교정 목적 아님 |
| 실손보험으로 돌려받은 의료비 | 본인부담 의료비 아님 |
| 본인부담상한제 사후환급금 | 건강보험공단 환급액 |
특히 병원에서 결제한 금액이 홈택스에 표시됐다고 해서 전액을 공제받을 수 있는 것은 아닙니다.
미용 목적의 비용이나 보험금으로 보전받은 금액이 포함되어 있다면 제외해야 합니다.
홈택스에서 의료비 조회가 안 된다면?
실제 병원에 다녀왔는데 연말정산 간소화 자료에 의료비가 표시되지 않는 경우가 있습니다.
의료기관의 자료 제출 누락이나 지연, 제출자료 오류 등이 원인일 수 있습니다.
이럴 때는 다음 순서로 해결하면 됩니다.
1. 간소화 확정자료 다시 확인
간소화 서비스 개통 첫날에는 의료기관의 수정자료가 아직 반영되지 않았을 수 있습니다.
2025년 귀속 연말정산에서는 2026년 1월 15일 서비스를 개통하고, 1월 20일부터 최종 확정자료를 제공했습니다.
2026년 귀속 연말정산에서도 국세청이 별도로 안내하는 확정자료 제공일을 확인한 뒤 다시 조회하는 것이 좋습니다.
2. 조회되지 않는 의료비 신고센터 이용
국세청은 연말정산 간소화 서비스 개통 직후 ‘조회되지 않는 의료비 신고센터’를 운영합니다.
2025년 귀속 연말정산에서는 2026년 1월 15일부터 17일까지 신고를 접수했습니다.
홈택스에서는 다음 경로로 이용하도록 안내했습니다.
장려금·연말정산·기부금 → 연말정산간소화 → 영수증 발급처 자료 제출 → 조회되지 않는 의료비 신고센터
신고를 접수하면 국세청이 관련 의료기관에 자료 제출을 안내합니다.
다만 신고센터에 접수했다고 해서 의료비가 반드시 반영되는 것은 아닙니다.
또한 2026년 귀속 신고센터 운영기간은 2027년 국세청 공지에서 확인해야 합니다.
3. 병원 영수증 직접 제출
신고센터 운영기간이 끝났거나 간소화 자료에 끝까지 반영되지 않았다면 의료기관에서 직접 증빙서류를 발급받으면 됩니다.
대표적인 서류는 다음과 같습니다.
- 병원 진료비 계산서·영수증
- 진료비 납입확인서
- 약국 약제비 영수증
- 시력교정용 안경 구입확인서
- 보청기 구입영수증
- 산후조리원 이용료 영수증
이러한 서류는 회사 연말정산 담당자에게 제출하면 됩니다.
단순한 카드 결제내역만으로는 공제 대상 의료비인지 확인하기 어려울 수 있으므로 의료비 지출 목적과 금액이 확인되는 증빙을 준비하는 것이 좋습니다.
의료비 공제액은 얼마나 나올까?
의료비 세액공제는 일반적으로 총급여의 3%를 초과하는 의료비에 대해 15%의 세액공제율을 적용합니다.
따라서 병원비를 많이 지출했다고 해서 전액의 15%를 세금에서 공제받는 것은 아닙니다.
예를 들어 총급여가 5,000만 원인 근로자는 공제 대상 의료비가 150만 원을 넘어야 일반 의료비 세액공제액이 발생합니다.
다음은 일반 의료비 400만 원을 지출했고 실손보험금 등 보전받은 금액이 없다고 가정한 계산입니다.
| 총급여 | 총급여의 3% | 계산상 세액공제액 |
|---|---|---|
| 3,000만 원 | 90만 원 | 46만 5,000원 |
| 5,000만 원 | 150만 원 | 37만 5,000원 |
| 7,000만 원 | 210만 원 | 28만 5,000원 |
같은 400만 원을 지출하더라도 총급여에 따라 계산상 세액공제액이 달라집니다.
다만 실제 환급받는 금액은 결정세액과 다른 세액공제 항목에 따라 달라질 수 있습니다.
의료비 대상별 공제율과 한도
| 의료비 대상 | 세액공제율 | 공제 대상금액 한도 |
|---|---|---|
| 본인 | 15% | 한도 없음 |
| 65세 이상 | 15% | 한도 없음 |
| 6세 이하 | 15% | 한도 없음 |
| 장애인 | 15% | 한도 없음 |
| 건강보험 산정특례 대상자 | 15% | 한도 없음 |
| 미숙아·선천성이상아 | 20% | 한도 없음 |
| 난임시술비 | 30% | 한도 없음 |
| 일반 부양가족 | 15% | 연 700만 원 |
위 한도는 세액공제액 자체가 아니라 세액공제 대상 의료비 금액에 대한 한도입니다.
여러 유형의 의료비가 함께 발생한 경우에는 대상별 공제율과 한도를 반영해야 하므로 단순히 전체 의료비에 15%를 곱해서 계산하면 안 됩니다.
부모님과 배우자 의료비는 누가 공제받을까?
의료비 세액공제는 본인뿐 아니라 배우자와 생계를 같이하는 부양가족을 위해 지출한 의료비도 요건에 따라 공제받을 수 있습니다.
일반적인 기본공제와 달리 의료비 세액공제에서는 나이와 소득 요건을 적용하지 않는 특례가 있습니다.
다만 실제 의료비를 부담했는지, 다른 가족이 해당 부양가족을 기본공제 대상자로 신고했는지 등을 확인해야 합니다.
부모님 의료비
부모님의 소득이 있어 기본공제를 받지 못하더라도 실제로 부양하면서 의료비를 부담한 경우에는 공제받을 수 있습니다.
하지만 형이 어머니를 기본공제 대상자로 신고했다면 동생이 어머니 병원비를 지출했더라도 동생은 해당 의료비를 공제받을 수 없습니다.
또한 형제자매가 부모님 병원비를 각자 나누어 지출했다고 해서 각자 의료비 세액공제를 나누어 신청할 수 있는 것도 아닙니다.
따라서 부모님 의료비는 실제 부담자와 부양가족 공제 관계를 함께 확인해야 합니다.
맞벌이 부부 의료비
맞벌이 부부는 배우자를 위해 의료비를 실제 지출한 사람이 해당 의료비를 공제받을 수 있습니다.
의료비 세액공제는 총급여의 3%를 초과해야 하므로 급여가 낮은 배우자가 의료비를 실제 부담한 경우 공제 대상금액이 더 커질 수 있습니다.
그러나 이미 지출한 의료비를 연말정산할 때 임의로 한쪽에 몰아서 공제할 수 있는 것은 아닙니다.
실제 지출 사실과 공제 요건을 확인해야 하며, 다른 공제항목과 결정세액까지 고려하면 급여가 낮은 쪽이 반드시 유리한 것도 아닙니다.
의료비 조회할 때 실손보험금도 확인해야 하나요?
의료비 세액공제에서는 실손보험금으로 돌려받은 금액을 공제 대상 의료비에서 제외해야 합니다.
예를 들어 병원비 300만 원을 지출하고 실손보험금 200만 원을 받았다면 실제 부담한 100만 원을 기준으로 공제 가능 여부를 계산해야 합니다.
실손보험금 차감액과 정액형 보험금의 차이, 보험금을 다음 해에 받았을 때 수정신고하는 방법은 별도 글에서 확인할 수 있습니다.
회사 연말정산 마감 후 누락된 병원비를 발견했다면?
회사에 연말정산 자료를 제출한 뒤 의료비가 누락된 사실을 발견하는 경우도 있습니다.
이때는 회사의 연말정산 처리 상황에 따라 추가 제출이 가능한지 먼저 확인하는 것이 좋습니다.
회사 연말정산이 이미 완료됐다면 5월 종합소득세 확정신고 기간에 본인이 의료비를 추가 반영할 수 있습니다.
종합소득세 신고 기간까지 지나간 경우에는 법정 요건을 충족하면 경정청구를 통해 이미 납부한 세금의 환급을 신청할 수 있습니다.
경정청구는 원칙적으로 법정신고기한이 지난 후 5년 이내에 할 수 있습니다.
다만 누락된 의료비가 실제로 세액공제 대상인지, 기존에 납부한 세금이 있는지 등에 따라 환급 가능 여부는 달라집니다.
연말정산 의료비 공제 자주 묻는 질문
Q1. 지금 홈택스에 들어가면 2026년 의료비를 조회할 수 있나요?
2026년 10월 현재 2026년 귀속 연말정산 간소화 자료는 아직 제공되지 않습니다. 2027년 1월 중순 개통 후 확인할 수 있으며, 그전에는 심평원에서 일부 건강보험 진료내역을 미리 확인할 수 있습니다.
Q2. 피부과 진료비도 의료비 세액공제가 되나요?
아토피, 습진 등 질병 치료를 위한 의료비라면 공제 대상이 될 수 있습니다. 반면 단순한 피부 미용 목적의 시술비는 공제 대상에서 제외됩니다.
Q3. 치과 임플란트와 스케일링도 공제받을 수 있나요?
치료 목적의 임플란트와 스케일링 비용은 의료비 세액공제 대상에 포함될 수 있습니다. 다만 미용 목적의 치아미백 등은 제외됩니다.
Q4. 비급여 진료비도 연말정산 공제가 되나요?
네. 비급여 진료비라도 질병의 진찰·치료 목적 등 세법상 공제 요건을 충족하면 공제 대상에 포함될 수 있습니다. 다만 미용 목적의 비급여 시술은 제외됩니다.
Q5. 간소화 자료에 병원비가 빠져 있으면 공제받을 수 없나요?
아닙니다. 의료기관에서 진료비 영수증이나 납입확인서를 발급받아 제출하면 공제 요건을 충족하는 금액에 대해 공제받을 수 있습니다.
Q6. 심평원에서 조회한 병원비를 회사에 제출하면 되나요?
심평원의 내 진료정보 열람 자료는 참고용입니다. 연말정산 공제 증빙으로 사용하려면 홈택스 간소화 자료나 의료기관에서 발급받은 적격 영수증을 준비해야 합니다.
연말정산 의료비 공제 조회 전 체크리스트
연말정산 간소화 서비스에서 의료비를 조회한 뒤에는 다음 사항을 확인하는 것이 좋습니다.
- 병원과 약국의 의료비 지출내역이 모두 표시되는지
- 간소화 확정자료가 제공된 후 다시 확인했는지
- 치과 치료비와 비급여 진료비가 누락되지 않았는지
- 안경·보청기·산후조리원 비용을 확인했는지
- 실손보험금으로 돌려받은 금액을 제외했는지
- 부모님과 배우자의 의료비 공제 요건을 충족하는지
- 의료비 지출액이 총급여의 3%를 초과하는지
- 빠진 의료비에 대한 영수증을 준비했는지
연말정산 의료비 공제는 홈택스에서 조회한 금액을 확인하고, 누락된 공제 가능 의료비를 추가하며, 공제 제외 금액을 빼는 순서로 준비하는 것이 중요합니다.
2026년에 병원비를 많이 지출했다면 지금 심평원에서 진료내역을 미리 확인하고, 2027년 1월 홈택스 간소화 서비스가 개통되면 실제 지출액을 다시 대조해 보시기 바랍니다.
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